中藥丸藥的保存應密閉，防潮，置于室內陰涼干燥處。往往因為存放方式不當或存放時間過長，發生腐敗變質，已經變質的丸藥不能服用。因為變質的丸藥已經完全失效，不但不能治病，還能產生疾病。如何識別丸藥是否變質，除了視其生產日期外，常從以下三個方面入手：
　�。�1）看：看其外觀色澤。首先看其外部的包裹物有否異常，如其外面的包裝小紙盒或蠟殼已經霉變，那么里面的丸物十有八九也已經不新鮮。其次看其外觀色澤，如正常的蜜丸表面應該光滑圓潤，呈棕黃色至黑棕色。以朱砂為衣或金箔為衣時分別呈朱紅色、金黃色。貯存日久或包裝不嚴密的蜜丸可因失去水分而變硬，表面無光滑潤澤感，貯存不當或制作不衛生時常常有生蟲或霉變現象。

　�。�2）嗅：正常新鮮的丸藥有一股特殊的中藥香味，如是蜜丸應當還有蜜的香味。如有怪味、酸腐味而沒有正常的中藥味，表示已經變質。

　�。�3）嘗：直接用嘴嘗，通過味覺予以判斷。正常的丸藥味濃郁，變質的丸藥有酸腐味，無發粘感。起后空腹服藥，更是如此。